李登辉清除亲蒋势力内幕，把谁赶下台由宋楚瑜接替?
李登辉抓到“总统”和国民党代理党主席大权后，开始了巩固权力与政治清算的斗争。他一是巩固“拥李派”的权力;二是削弱“亲蒋派”的权力，消除对他实行独裁统治的威胁。在这一场实质是国民党内蒋经国去世后的权力大转移中，李登辉运用“本土化”“民主化”策略，一步一步将“亲蒋派”彻底击垮。
李登辉主导中常会大改组
李登辉巩固“拥李派”权力的第一步，就是利用中国国民党“十三全大会”提升自己的统治地位。1988年7月，国民党“十三全大会”召开，正式推举李登辉为党主席。李登辉正式当上中国国民党主席，也开启了将国民党撕裂和台湾社会引向动荡的先河。此说并非虚言。国民党“十三全大会”召开时，李登辉一是严把党代表关，出席会议的大部分代表必须是切断蒋家脐带、能够支持李登辉的人;二是严把中央委员关，李登辉通过对半数(180名)中央委员候选人的提名及操控选举，控制中央委员会的目的已经达到;三是严把中常委关，亲蒋的中常委中有12人被换掉，这是中国国民党第七次代表大会以来中常会规模最大的一次改组。
众所周知，李登辉接任“总统”时，“行政权”掌握在“行政院长”俞国华手中，“党权”掌握在中央党部秘书长李焕手中，“军权”掌握在“参谋总长”郝柏村手中，“国安会”掌握在“国安会秘书长”蒋纬国手中。面对蒋经国留下的“接班四人帮”格局，李登辉从削弱国民党实力和巩固自己在党内地位的角度考虑，必须加以摧毁。要实现这一目标，李登辉在正式出任党主席之后，利用“组阁”巩固和扩大“拥李派”权力。
国民党“十三全大会”召开一周后，7月20日召开中常会，根据李登辉提议，通过了内定的“行政院”改组名单：俞国华继续留任“行政院长”，施启扬为“行政院副院长”，许水德为“内政部长”，连战为“外交部长”……在新“内阁”中，有施启扬等9名本省籍“阁员”。李登辉利用不强势的俞国华的“空头院长”以减少对“总统”权力的牵制，把“内阁”成员尽可能换成亲李派，实现对“内阁”的控制。并且以此为基础，加快了党务、政治、军事及意识形态各个领域的全面“本土化”的步伐。
亲蒋势力出现极大分化
通过以上人事结构调整，可以看出国民党的政权结构已经发生很大变化。一是，李登辉的最高领导地位得到进一步确立。他继任“总统”是靠接收蒋经国的政治遗产，代理党主席险遭封杀，但此次却是以“十三全大会”形式选举为党主席并主导会议，在党内的领导地位得到肯定。
二是亲蒋势力出现了极大的分化。变化最大的是蒋经国原设计的集体接班格局出现重大裂变。最有代表性的是，集体接班中最为关键的中央党部秘书长李焕倒向李登辉。蒋经国生前安排李焕为国民党中央秘书长，目的就是维持派系均衡。然而，他先是放任宋楚瑜，使李登辉顺利抓到代理党主席大权;在“十三全大会”上，支持李登辉打压票选;而后，又急于排挤俞国华“组阁”。多年追随蒋经国的李焕尚且如此，另一个深得蒋经国信任的宋楚瑜更是充当倒蒋与拥李的急先锋。
第三“本土化”趋势十分明显。国民党“十三全大会”正式决定由本省籍人担任党主席，在中常委中本省籍成员首次超过半数，中央委员中本省籍成员首次超过1/3。“本土化”开始于蒋经国上任之初，是为了缓和省籍矛盾。而李登辉的“本土化”，着眼点是把国民党视为“外来政权”，为了改造“外来政权”，必须以本土势力来取代外省籍，巩固权力基础。
俞国华最先被赶下台
第十三次代表大会后，李登辉在党内的领导地位得到巩固，他开始全方位、多层次打压党内的所谓非主流派势力，国民党内从此不得安宁，台湾政坛从此不得安宁。“总统府秘书长”沈昌焕是蒋家两代重臣，也是宋美龄宠信之人，一直控制台湾的“外交”事务。1988年10月，李登辉借故逼他辞职，安排亲信李元簇继任秘书长。
李登辉的目的是要逐渐清除“接班四人帮”。当他的权力得到相当的巩固后，把清除亲蒋派的目光瞄向了“接班四人帮”中当时处境最不乐观的俞国华。亲李派不断出面制造“俞国华是国民党的负债，而非资产”的假象的同时，又利用“立法委员”吴春晴质询俞国华涉嫌早年曾包养酒家女的绯闻引爆风波。万般无奈之下，俞国华于1989年5月17日向李登辉提出辞职报告。5月26日，李登辉顺水推舟，准许俞国华辞职。国民党“十三全大会”之后，李焕“组阁”的欲望特别强烈，可以说是志在必得，非要挤俞国华下台。可以说，俞国华下台既是国民党内争权夺利的结果，也是李登辉打压蒋经国集体接班构想与排除蒋家势力的结果。
亲信宋楚瑜控制党务系统
俞国华下台后，李登辉提名李焕继任“行政院长”。5月31日，国民党方面宣布李焕“内阁”成立，6月1日，李焕转任“行政院长”，登上仕途的巅峰。李登辉主导的第二次“内阁”改组，以同意俞国华辞职、提升同为“接班四人帮”成员的李焕的形式，不露声色地“冷冻”俞国华，使得蒋经国安排的集体接班成员先失一将，这为李登辉从更深层次考虑权力基础和人事组合创造了条件。
李登辉更深的考虑是，在打压“接班四人帮”的同时，完成党政军系统的改造，扩大自己掌权的政治基础。他之所以拿出“行政院长”职位，是因为“行政院长”是官场重臣、“顾命大臣”们求而难得的职位，可以以此为诱饵，进行调虎离山，实现巩固权力计划，调升李焕就是如此。李登辉收回了李焕控制的党务系统后，任命其亲信宋楚瑜接替中央党部秘书长职务，对党务系统进行了彻底改革，全面清除亲蒋势力，推行“本土化”。